Stjepan Loncar è un centrocampista del Kortrijk che è sceso in campo nella maggior parte delle gare della sua squadra in First Division A nel 2022/2023, avendo collezionato 22 presenze, per un totale di 1179 minuti. É partito titolare in 13 presenze su 34 giornate ed è subentrato 9 volte.
Loncar ha giocato la sua ultima gara il 23 aprile, con il Kortrijk: una sconfitta per 4-2 contro Union Saint-Gilloise, in cui ha giocato 84 minuti. In totale il centrocampista ha offerto 1 assist in questa stagione. Ha ricevuto 5 cartellini gialli.
Nella passata stagione di NB I Loncar ha giocato 19 partite con Ferencváros, gare in cui ha segnato 2 gol.
Loncar è passato a giocare in prestito con il Kortrijk nel settembre 2022. In precedenza giocava per Ferencváros, per cui ha collezionato 20 presenze in campionato, con 2 gol, dopo aver raggiunto il club nel luglio 2021, mentre prima giocava per Rijeka.