Nathan Thompson Peterborough United è sceso in campo nella maggior parte delle gare della sua squadra in Championship nel 2021/2022, avendo collezionato 27 presenze, per un totale di 2430 minuti. É partito titolare in 27 presenze, su 46 giornate.
La sua ultima presenza nella competizione è stata il 19 febbraio, gara in cui ha giocato 90 minuti con la maglia Peterborough United contro Derby County, nella sconfitta per 1-0. In totale il difensore ha realizzato 1 rete in questa stagione. Ha ricevuto 8 cartellini gialli.
Il suo primo gol nel campionato è arrivato in una sconfitta 3-1 contro Reading il 14 settembre.
Thompson ha giocato 39 partite di League One nell'ultima stagione con Peterborough United, gare in cui ha segnato 2 gol e fornito 3 assist vincenti.
Il difensore è passato a giocare con Peterborough United nell'agosto 2019, mentre prima giocava con Portsmouth, con cui ha collezionato 69 presenze in campionato, con 4 assist forniti.