Markus Karlsbakk è un centrocampista Aalesund che è sceso in campo nella maggior parte delle partite della sua squadra in Eliteserien nel 2020, avendo collezionato 19 presenze, per un totale di 537 minuti. É partito titolare in 4 presenze su 30 giornate ed è stato utilizzato spesso come subentrato, in 15 occasioni.
La sua ultima apparizione in Eliteserien è stata il 22 dicembre, partita in cui ha giocato 20 minuti con la maglia Aalesund contro Mjøndalen, nella sconfitta per 3-0. In totale il centrocampista ha segnato 2 reti nel 2020.
É stato contro Strømsgodset il 9 dicembre che Karlsbakk ha segnato il suo ultimo gol, nella sconfitta per 4-1. Ha aperto le sue marcature in questo campionato contro Kristiansund il 4 ottobre, avendo realizzato una rete nella sconfitta per 2-1.
Karlsbakk non ha giocato nemmeno una partita di 1. Division nell'ultima stagione con Aalesund.