Il difensore Viktoria Plzeň Jakub Brabec è sceso in campo nella maggior parte delle gare del suo club in Czech Liga nel 2020/2021, avendo collezionato 31 presenze, per un totale di 2785 minuti. É stato scelto nell'11 iniziale in tutte le 31 presenze, su 34 giornate.
Brabec ha collezionato la sua ultima presenza il 29 maggio, con Viktoria Plzeň: una vittoria per 3-1 contro Opava, in cui ha giocato 90 minuti. In totale il difensore ha segnato 3 reti nel 2020/2021.
É stato contro Baník Ostrava il 23 maggio che Brabec ha segnato il suo ultimo gol, nella vittoria per 4-0. Ha aperto le sue marcature in questo campionato contro Příbram l'8 maggio, avendo realizzato una rete nel pareggio 3-3.
Brabec ha giocato 32 partite di Czech Liga nell'ultima stagione con Viktoria Plzeň, realizzando 1 gol.
Prima di cominciare l'esperienza con Viktoria Plzeň nel luglio 2019, Brabec ha collezionato 17 presenze in campionato con Rizespor.