Il centrocampista Raków Częstochowa Giannis Papanikolaou non ha preso parte a molte delle partite del club in Ekstraklasa nel 2020/2021, avendo collezionato 7 presenze, per un totale di 103 minuti. È partito titolare in 1 di queste presenze su 30 giornate ed è stato frequentemente utilizzato come subentrato, in 6 occasioni.
Papanikolaou ha giocato la sua ultima gara il 21 febbraio, con Raków Częstochowa: una vittoria per 2-1 contro Zagłębie Lubin, in cui ha giocato 60 minuti.
Nella passata stagione di Super League 1 Papanikolaou è sceso in campo in 30 partite con Panionios, gare in cui ha fornito 1 passaggio vincente.
Prima di arrivare a vestire la maglia Raków Częstochowa nell'agosto 2020, Papanikolaou ha collezionato 30 presenze in campionato con Panionios, per un totale di 1 assist.